Institution créée par Henri IV en 1604 « pour instruire la jeunesse et la rendre amoureuse des sciences, de l’honneur et de la vertu, pour être capable de servir au public… », le Prytanée national militaire est resté, depuis quatre siècles, fidèle à sa mission originelle. Le Prytanée, dans l’Athènes du siècle de Périclès, abritait les prytanes, magistrats suprêmes de la cité grecque. Ce nom fut repris au XIX^e siècle pour désigner l’établissement. Dans cette même volonté, le "vieux bahut" entame sa marche vers 2030, pour demeurer dans l’excellence académique et sociale.

Aujourd'hui, le Prytanée accueille environ 945 élèves. L'établissement prépare aux baccalauréats général et technologique. Il est doté de classes préparatoires aux études supérieures et de classes préparatoires aux grandes écoles.